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系统科学 7

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仿真技术 5

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复杂系统 4

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类器官技术及其在消化系统肿瘤的临床应用 Review

赵晓芳, 姜有海, 刘春良, 侯明慧, 王红阳, 付静

《工程(英文)》 2022年 第9卷 第2期   页码 123-130 doi: 10.1016/j.eng.2021.04.017

摘要:

消化系统肿瘤包括食管癌、胃癌、结直肠癌、肝癌和胰腺癌,在全球的发病率和死亡率都很高。由于目前的肿瘤研究模型不能完全模拟原始肿瘤的关键特征,常导致基础研究不能转化用于临床实践。肿瘤发病机制的探索和抗癌药物的开发迫切需要更优化的肿瘤模型。利用肿瘤患者的组织可以高效地建立正常和肿瘤类器官。本文总结并讨论了消化系统类器官的构建方法,及其作为一种新模型在基础癌症研究、临床前实践和个性化治疗中的应用。

关键词: 类器官     消化系统肿瘤     个性化治疗    

肿瘤临床大数据管理系统设计与应用

马麟,包晨露,李青,吴静依,潘虹安,李鹏飞,张路霞,詹启敏

《中国工程科学》 2022年 第24卷 第6期   页码 127-136 doi: 10.15302/J-SSCAE-2022.06.011

摘要:

肿瘤是人类生命健康的重要威胁,随着我国医疗行业信息化的发展,医疗机构积累了大量的肿瘤临床数据,但因数据标准不统一、治理难度大等原因制约了数据价值的充分挖掘;应用人工智能(AI)等前沿信息技术建设肿瘤临床大数据管理系统,有助于肿瘤临床数据的深入应用、临床诊疗管理质量与效率提升。本文剖析了我国肿瘤临床数据治理与应用面临的问题及挑战,研判了肿瘤临床大数据管理体系的应用价值;针对肿瘤临床数据多来源、多模态的复杂特性,探索了AI 技术应用于肿瘤临床大数据管理与科研的机制及路径;设计了包括肿瘤通用数据模型构建、临床数据采集与安全管理、标准化结构化治理、分析与建模应用、数据质量管理在内的全流程解决方案,阐述了相应系统的建设框架与技术体系;以某三甲医院肺癌临床大数据平台为案例,展示了所提方案在临床实践中的可行性及应用价值相关研究可为丰富我国肿瘤临床大数据管理系统的建设实践、探讨领域未来重点研究方向提供参考和启示。

关键词: 临床大数据;管理系统肿瘤;人工智能;通用数据模型;自然语言处理    

肿瘤特异性环状RNA来源抗原肽被证实存在于肝胆肿瘤 Article

王文闻, 马莉丽 , 邢政, 苑廷淦, 包金霞, 朱妍静, 赵晓芳, 赵燕, 宗雅丽, 张雅妮, 莘似韵, 邱辛瑶, 杨帅, 王红阳, 高栋, 王鹏, 陈磊

《工程(英文)》 2023年 第22卷 第3期   页码 159-170 doi: 10.1016/j.eng.2022.06.008

摘要:

由于缺乏经证实具备免疫原性的多肽,基于肿瘤抗原的免疫治疗应用受到限制。在本研究中,利用肝胆肿瘤类器官分析了环状RNA(circRNA)作为肿瘤抗原肽新来源的潜力。使用RNA测序(RNA-seq)和基于算法的评分工具,预测出27 个类器官中3950 个肿瘤特异性circRNA 可翻译18 971 条抗原肽。值得注意的是,来自circTBC1D15 的抗原肽YGFNEILKK不仅可以被HLA-ABC呈递,还能活化T细胞,显著降低肿瘤类器官活率。本研究的发现提供了一种产生肿瘤抗原的重要来源,提示肿瘤特异性circRNA 可作为抗肿瘤靶点。

关键词: 肿瘤抗原     患者来源肝胆肿瘤类器官     环状RNA     基于质谱的免疫肽组学    

利用纳米粒子进行肿瘤分子成像 Review

程震,闫雪峰,孙夕林,申宝忠,Sanjiv Sam Gambhir

《工程(英文)》 2016年 第2卷 第1期   页码 132-140 doi: 10.1016/J.ENG.2016.01.027

摘要: 多模态纳米粒子可对肿瘤的生物性和微环境做出精确评估。本文讨论了与工程化纳米粒子相关的话题,并总结了近几年来这些纳米结构在恶性肿瘤光学成像、超声成像、光声成像、磁共振成像和放射性核素显像中的应用;同时,还讨论了将纳米粒子应用到临床医学中面临的主要挑战。

关键词: 肿瘤     分子成像     纳米粒子    

基于核稀疏表示的磁共振图像分析及其在脑肿瘤自动分割中的应用 None

Ji-jun TONG, Peng ZHANG, Yu-xiang WENG, Dan-hua ZHU

《信息与电子工程前沿(英文)》 2018年 第19卷 第4期   页码 471-480 doi: 10.1631/FITEE.1620342

摘要: 肿瘤分割在疾病辅助诊断、治疗方案规划以及手术导航中扮演重要角色。对脑肿瘤精确分割可以帮助临床医生获取肿瘤位置、尺寸和形状信息。首先对MRI图像进行预处理以减少噪声,然后通过核字典学习提取非线性特征,用来构建坏死组织、水肿组织、非增强肿瘤组织、增强肿瘤组织和健康组织5个适应性字典。为评估分割表现,分割结果被上传到在线评估系统中,该评估系统使用dice系数、阳性预测值(positive predictive value, PPV)、灵敏度和kappa值作为评估指标。结果表明,该方法在完整肿瘤区域分割上具有良好表现(dice: 0.83; PPV: 0.84; sensitivity: 0.82),而在肿瘤核心区域(dice: 0.69; PPV: 0.76; sensitivity相较于脑肿瘤分割(BRATS)挑战中其他团队采用的方法,该方法具有竞争力。该方法在健康组织和病理组织区分上具有一定潜力。

关键词: 肿瘤分割;核方法;稀疏编码;字典学习    

肿瘤诊疗新方法与新技术

王红阳, 杨胜利

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期   页码 1343-1344 doi: 10.1016/j.eng.2021.08.002

肠道菌群与肿瘤发生及肝病

吕桂帅, 程宁涛, 王红阳

《工程(英文)》 2017年 第3卷 第1期   页码 110-114 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.017

摘要:

一个多世纪以前,科学家们就首次发现了肿瘤区域中细菌的存在。但是,微生物在肿瘤发生中的作用近年来才被认识到。近几十年来,与肠道菌群失调相关的疾病代表了全世界最严重的一些公共卫生问题。大量的流行病学研究表明,肠道菌群与某些常见肿瘤密切相关。然而,肠道菌群与肿瘤相关联的具体分子机制仍不明确。研究表明,肠道菌群的改变有助于确定肝癌、酒精相关肝病、非酒精性脂肪肝和肝硬化的发生和发展。鉴于益生菌是一种可通过调节免疫系统促进人类健康的药物,其可能会为肝细胞癌(HCC) 和非酒精性脂肪肝的治疗提供新方向。本文总结了肠道菌群在肿瘤及肝病中的研究进展,综述了肠道菌群与肿瘤和肝病之间的关系。

关键词: 肠道菌群     稳态失调     肿瘤发生     肝细胞癌     非酒精性脂肪性肝病    

用于器官芯片的工程化血管系统 Review

Abdellah Aazmi, 周竑钊, 李雨亭, 俞梦飞, 许晓斌, 吴钰桐, 马梁, 张斌, 杨华勇

《工程(英文)》 2022年 第9卷 第2期   页码 131-147 doi: 10.1016/j.eng.2021.06.020

摘要: 血管系统是人体内最丰富的器官,在氧气交换和物质传递中起着至关重要的作用,是组织器官生存的决定性因素。因此,必须将血管系统集成到器官芯片中,以重建组织和器官微环境及其生理功能。最后,概述了这项技术在器官和肿瘤培养这个有极具吸引力且快速发展的领域的适用性。

关键词: 器官芯片     血管     生物打印     肿瘤芯片    

基于飞秒激光的用于捕获肿瘤细胞的聚合物芯片实验室的智能程序 Article

Annalisa Volpe, Udith Krishnan, Maria Serena Chiriacò, Elisabetta Primiceri, Antonio Ancona, Francesco Ferrara

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期   页码 1436-1442 doi: 10.1016/j.eng.2020.10.012

摘要: 本文描述了一个微流控工具的实现过程,从计算机辅助设计(CAD)到作为循环肿瘤细胞(CTC)捕获工具应用的概念验证。整个平台通过使用聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)及结合飞秒(fs)激光和微铣制造技术实现。

关键词: 芯片实验室     飞秒激光     循环肿瘤细胞     即时医疗     热键合     聚合物    

生物质垃圾制沼气技术综述 Review

Spyridon Achinas, Vasileios Achinas, Gerrit Jan Willem Euverink

《工程(英文)》 2017年 第3卷 第3期   页码 299-307 doi: 10.1016/J.ENG.2017.03.002

摘要: 目前的研究认为厌氧消化是一种高效的可替代技术,其既能产生生物燃料,又能可持续地处理垃圾。在沼气工业,为了促进沼气的生成和提高质量,有几种不同的技术趋势。然而,投资厌氧消化的成功取决于原料成本低和沼气使用范围广( 热能、电能和燃料)。在欧洲能源市场,沼气的生产一直在增长,为生物能源的发展提供了一条经济的替代选择。

关键词: 厌氧消化     沼气     可持续能源     木质纤维素垃圾     微生物生态学    

血清免疫球蛋白G N-糖基的高通量分析——一种消化道癌症的非侵入性生物标志物 Article

刘鹏程, 王小兵, 顿爱社, 李昱潼, 李厚强, 王璐, 张怡春, 李灿灿, 张金霞, 张晓雨, 马立兴, 侯海峰

《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期   页码 44-53 doi: 10.1016/j.eng.2023.02.008

摘要: 本研究旨在评价IgG N-糖基在消化道癌症亚型中的诊断效能。从中国医学科学院肿瘤医院招募749名消化道癌症患者,包括食管癌 (esophageal cancer, EC)、胃癌 (gastric cancer, GC)、结直肠癌 (colorectal cancer采用Bio-Plex悬液芯片系统检测方法(Bio-Rad)进行炎症因子检测。采用典型相关分析(canonical correlation analysis, CCA)探索糖基和炎症因子之间的相关性。与健康对照组相比,EC、GC、CRC和PC患者的唾液酸化和半乳糖基化水平降低,而二等分乙酰葡萄糖胺基化水平在消化道癌症患者中升高。 此外,只有胰腺癌患者具有低水平的岩藻糖基化。这些研究结果表明,IgG N-糖基在调节消化肿瘤的发病机制中发挥了重要作用。血清IgG N-糖基可以作为潜在的非侵入性辅助消化道癌症临床诊断的方法。

关键词: 消化道癌症     糖基化     免疫球蛋白 G     诊断生物标志物    

纳米技术——一种针对促肿瘤中性粒细胞的肺癌治疗新策略 Review

张健, 蒋莎莎, 李仕林, 江继鹏, 梅婕, 陈延东, 马永富, 刘阳, 刘颖​​​​​​​

《工程(英文)》 2023年 第27卷 第8期   页码 106-126 doi: 10.1016/j.eng.2022.11.006

摘要:

原发性肺癌和转移性肺癌都是肺部恶性肿瘤,两者都威胁着患者的生命,但各自的发病机制不同。肿瘤的发生和发展涉及肿瘤细胞与宿主微环境之间的交流,中性粒细胞是肿瘤微环境(TME)中最丰富的免疫细胞,它们参与炎症环境的形成,并通过其抗肿瘤和促肿瘤能力影响患者的生存。中性粒细胞可根据不同的标准分为不同的类别,常见的类别包括 N1 抗肿瘤中性粒细胞和 N2 免疫抑制中性粒细胞。中性粒细胞的抗肿瘤作用是通过活性氧、肿瘤坏死因子相关的细胞凋亡诱导配体、高级糖化终产物受体-胰蛋白酶 G 等因素共同作用以及调节其他免疫细胞的活动共同介导的。中性粒细胞作为肿瘤促进因子,也可通过影响包括癌症发生、血管生成、癌细胞增殖和侵袭能力等过程,促进肺癌的发展和转移,并在其他癌症的肺转移中发挥类似作用。

关键词: 肺癌     转移     中性粒细胞     肿瘤微环境     纳米技术    

2019中国消化内镜学年会

会议日期: 2019年10月18日

会议地点: 中国/北京/东城

主办单位: 中华医学会

中华医学会第十九次全国消化系病学术会议暨2019中国消化病学大会

会议日期: 2019年09月27日

会议地点: 中国/贵州/贵阳

主办单位: 中华医学会

2021中国肿瘤学大会在郑州召开

会议日期: 2022年04月27日

会议地点: 中国

主办单位: 中国工程院

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类器官技术及其在消化系统肿瘤的临床应用

赵晓芳, 姜有海, 刘春良, 侯明慧, 王红阳, 付静

期刊论文

肿瘤临床大数据管理系统设计与应用

马麟,包晨露,李青,吴静依,潘虹安,李鹏飞,张路霞,詹启敏

期刊论文

肿瘤特异性环状RNA来源抗原肽被证实存在于肝胆肿瘤

王文闻, 马莉丽 , 邢政, 苑廷淦, 包金霞, 朱妍静, 赵晓芳, 赵燕, 宗雅丽, 张雅妮, 莘似韵, 邱辛瑶, 杨帅, 王红阳, 高栋, 王鹏, 陈磊

期刊论文

利用纳米粒子进行肿瘤分子成像

程震,闫雪峰,孙夕林,申宝忠,Sanjiv Sam Gambhir

期刊论文

基于核稀疏表示的磁共振图像分析及其在脑肿瘤自动分割中的应用

Ji-jun TONG, Peng ZHANG, Yu-xiang WENG, Dan-hua ZHU

期刊论文

肿瘤诊疗新方法与新技术

王红阳, 杨胜利

期刊论文

肠道菌群与肿瘤发生及肝病

吕桂帅, 程宁涛, 王红阳

期刊论文

用于器官芯片的工程化血管系统

Abdellah Aazmi, 周竑钊, 李雨亭, 俞梦飞, 许晓斌, 吴钰桐, 马梁, 张斌, 杨华勇

期刊论文

基于飞秒激光的用于捕获肿瘤细胞的聚合物芯片实验室的智能程序

Annalisa Volpe, Udith Krishnan, Maria Serena Chiriacò, Elisabetta Primiceri, Antonio Ancona, Francesco Ferrara

期刊论文

生物质垃圾制沼气技术综述

Spyridon Achinas, Vasileios Achinas, Gerrit Jan Willem Euverink

期刊论文

血清免疫球蛋白G N-糖基的高通量分析——一种消化道癌症的非侵入性生物标志物

刘鹏程, 王小兵, 顿爱社, 李昱潼, 李厚强, 王璐, 张怡春, 李灿灿, 张金霞, 张晓雨, 马立兴, 侯海峰

期刊论文

纳米技术——一种针对促肿瘤中性粒细胞的肺癌治疗新策略

张健, 蒋莎莎, 李仕林, 江继鹏, 梅婕, 陈延东, 马永富, 刘阳, 刘颖​​​​​​​

期刊论文

2019中国消化内镜学年会

2019年10月18日

会议信息

中华医学会第十九次全国消化系病学术会议暨2019中国消化病学大会

2019年09月27日

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2021中国肿瘤学大会在郑州召开

2022年04月27日

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